Aus pflanzlich-geographischer Sicht hat der Bereich um das Flüsschen Pazinčica einen submediterranen Charakter.
Die hier wachsende Pflanzengemeinschaft besteht größtenteils aus Laubbaumarten und Büschen.
Die thermophile (wärmeliebende) Vegetation ist an folgenden zwei Standorten vertreten:

• Waldzone mit Flaumeichen und Orient-Weißbuchen (Querco-Carpinetum orientalis)

            - die thermophilste Waldgemeinschaft

• Waldzone mit Flaumeichen und Hainbuchen (Ostrio-Quercetum pubescentis)

- im Bereich des Flüsschen Pazinčica am meisten verbreitet
- auf Buschhöhe sind der Gemeine Hartriegel, die Felsenkirsche, der Perückenstrauch und        die gemeine Liguster ansässig

An den kälteren, nördlichen Bachstürzen und Bacheinschnitten, insbesondere auf Flyschböden, sind Bestände einer mesophilen Vegetation anzutreffen, d.h. eine Pflanzenwelt, die mittlere Feuchtigkeitsverhältnisse bevorzugt.
Sie ist in folgenden Waldgemeinschaften vertreten:
·    küstennaher Buchenwald mit herbstlichem Blaugras
- wächst in niedrigeren Lagen und engen Tälern
·    Traubeneichenwälder mit herbstlichem Blaugras
Die mikroklimatischen Bedingungen innerhalb der Höhle teilen die Flora anscheinend in zwei Segmente.
Am Rand der Höhle und an den sonnigen Seiten, gibt es hauptsächlich Arten mit thermophilem Charakter: verschiedene Schilfe, Nieswurz, Gemeiner Gamander, Fenchel.
An den schattigen, nördlichen und nordöstlich gelegenen Hängen der Höhle gibt es Arten mit ausgesprochen mesophilem Charakter: Hexenkraut, Gemeiner Zungenfarn, Tote Brennessel.
Daneben findet man auch eine Menge Farnpflanzen, Moose und Pilze.

Um die Höhle herum wachsen auch eine große Zahl gefährdeter und geschützter Arten der Bodenflora.
Die goldene Lilie und die istrische Nieswurz sind streng geschützt, und bei den nachfolgend erwähnten Pflanzen handelt es sich um geschützte Heimatarten;

• Waldalpenveilchen
• Leberblümchen
• Kleines Immergrün
• Aaronstab
• Wilde Narde
• Brachdistel
• Schneeglöckchen
• Fetthenne
• Vielblütiges Weißwurz oder Salomossiegel

Auf den die Höhle umgebenden Felsen, aber auch an den Mauern um das Paziner Kastell, sowie auf dem Turm der Nikolauskirche, findet sich auch häufig eine endemische Sorte, die Pyramidenglockenblume (Campanula pyramidalis).